일반기술

DHPLC를 위한 최적 온도 결정을 위한 소프트웨어

변성 고성능 액체 크로아토그래피(DHPLC)는 하나 또는 그 이상의 기저쌍을 동일성과 다른 DNA 듀플렉스를 분리한다. DHPLC는 듀플렉스의 사이트 용융 온도 부근에서 가장 효율적인 것이다. 따라서 DHPLC를 실행하기 위한 사이트 용융 온도를 빠르게 결정하기 위한 작은 입력의 요구에 의해 이 소프트웨어는 시간과 돈을 절약한다. 이 소프트웨어는 실험 데이터에서 적합한 용융 온도 예측으로 간단한 시뮬레이티드 어닐링 알고리즘을 이용하여 얻어진 파라미터들을 사용한다. 사례의 95% 이상에서 이 소프트웨어는 실험적으로 섭씨 3도 이내의 최적 온도를 생성하는 것을 예측한다. 더욱이 50% 이상의 이 소프트웨어는 최적 온도를 섭씨 1도 이내로 예측한다. http://otl.dtanford.edu/industry/resources/rts.html에 자세한 내용이 나와있다.몇 가지 온도에서 실행 시험을 포함한 보다 빠른 시험 결정과 적응 비용