일반기술

격자 모델과 알고리즘

무가공 인자 표현 데이터는 일반적으로 대규모 테이블 속으로 조직하였다. 각 인자에 대한 하나의 행이 있음과 각 표본과 클론에 대하여 하나의 열이 존재함을 연구하였다. 이 데이터에 대한 공통의 목적은 인자의 동일 그룹화이며 표본에서 유사하게 표현하기 위함이다. 표본 내의 동일 그룹화에서 많은 관심이 존재한다. 유사한 표현은 인자의 유사한 결과가 될 수 있으며 또한 표본의 유사한 조건이 될 수 있다. plaid 모델은 층이라고 불리는 간단한 2방향 anova 모델의 합으로서 미가공 데이터의 표현이다. 각 층들은 표본의 부집합과 인자의 부집합으로 정의된다. 인자는 층의 표본상의 유사한 표현 패턴이 나타내는 주어진 층에서 함께 나타난다. 이 발명품은 개별적인 층을 찾기 위한 알고리즘이며 그들을 얼마나 많이 사용하는가를 결정하기 위한 알고리즘이다. 보다 많은 정보는 http://www.standford.edu/∼owen/plaid에 가면 찾을 수 있다.유사한 기능을 찾기 위한 층으로서 미가공 유전자 표현 데이터의 모델링 허용