일반기술

GENSCAN : 사람 게놈 염기 서열에서의 유전자 동정

GENSCAN은 게놈 DNA 염기 서열에서 완전한 유전자 구조 예측을 위해 디자인된 프로그램이다, 이 프로그램은 코딩 엑손, 인트론, 촉진 유전자 그리고 폴리-아데닐화 신호를 포함한다, GENSCAN은 완전한 유전자뿐만 아니라 부분 유전자 예측도 가능하고 DNA 가닥의 한 쪽이나 양쪽상의 단일 염기 서열내 다중 유전자의 빈도도 예측할 수 있다, 이 프로그램은 유전자 구조/조성 성질의 엄격한 확률 모델로 예측은 단백질 서열 유사성에서 유래된 유전자에 독립적이거나 상보적인 정보를 제공한다, 프로그램 출력물은 상응하는 펩티드 서열과 함께 한 개 이상(제로도 가능) 예측된 유전자 리스트이다, 그래픽 출력(PostScrip 혹운 gif 형식)은 예측된 엑손 위치를 알려 준다, 서열내 유전자의 가장 최적화된 쌍뿐만 아니라 "하부최적" 엑손 즉 높은 가능성을 가지나 프로그램의 디폴트 출력에는 포함되지 않는 것도 프로그램은 생성해 준다, 하부최적 엑손은 몇 경우에 있어서 표준 방법으론 예측하기 어려운 엑손이나 선택적 스플라이싱된 엑손에 해당된다개선된 정확성, 완전 유전자뿐만 아니라 부분 유전자도 예측, 한 쪽 혹은 두 가닥 DNA 상의 단일 염기 서열내 유전자 예측, 하부최적/선택적 엑손의 예측