일반기술

단백질 RNA 상호작용 검출시스템

단백질-RNA 상호작용은 기본 세포 과정에서 중추적인 요소이다. 하지만, 생체 내에서 이를 분석할 수 있는 방법은 거의 없다.개발된 본 시스템은 생체 내에서 단백질-RNA 간의 상호작용을 분석할 수 있는 분석법이다. 본 유전자 시스템은 검출이 용이한 단백질을 발현하는 검출 가능한 유전자를 함유하는 숙주세포와 3개의 서로 다른 키메라 유전자, 2개의 암호화된 하이브리드 단백질, 1개의 암호화된 하이브리드 RNA를 포함한다. 각각의 하이브리드 단백질은 RNA와 상호작용 한다. RNA와 단백질 간에 상호작용이 일어날 경우, 검출 가능한 유전자의 발현이 상호작용이 없었을 때보다 크게 증가한다.1. 시스템은 1) 분석법의 유용성을 증명, 다양한 용도로 사용이 가능한 플라스미드와 균주, 2) 각각의 하이브리드 구성요소를 암호화하는 양성 대조구, 3) 적절한 효모 균주를 포함.2. 하이브리드 단백질과 하이브리드 RNA간의 상호작용을 검출.3. 알려진 RNA-단백질 상호작용을 억제하는, 임상적으로 또는 생물학적으로 관심있는 저분자 물질들의 동정.4. 생물학적 활성을 지니는 알려진 RNA 분자 뿐만 아니라, 단백질-RNA 상호작용이 조절되는 상황 하에서 알려진 단백질과 상호작용 하는 RNA를 암호화하는 유전자와 상호작용을 하는 단백질을 암호화하는 새로운 유전자를 동정.5. RNA-단백질 상호작용의 친화도를 생체 내에서 분석할 수 있으며, 치료용 단백질과 RNA를 설계하는데 유용.