일반기술

DNA 분자에서 Abasic sites 식별을 위한 방법

개별 DNA 분자들에서 abasic sites를 검출하는 새로운 방법이 개발되었다. Abasic sites는 apurinic/apyrimidinic sites (AP sites)로 알려져 있는데 DNA에서 발생하는 가장 일반적인 손상 중 하나이다. AP sites는 탈아미노화된 염기의 제거로부터 이어지는 자발적인 탈퓨린화 또는 탈아미노화로부터 DNA에서 발생할 수 있다. DNA 돌연변이, 세포 사망과 발암의 결과를 낼 수 있다. AP sites를 쉽게 검출할 수 있는 방법은 DNA 진단에서 결정적인 것이다. 원자력 현미경과 biotinylated 탐침을 이용한다. 이 탐침은 AP sites에 결합된다. Biotinylation 반응에 이어 DNA-결합 탐침은 아비딘과 접합되고 AP site는 AFM(atomic force microscope)에 의해 보여진다.일반적으로 DNA에 있는 AP site의 신체 위치나 분포를 결정하는 방법은 없다. 개별적 AP sites가 단일 DNA 분자에서 분류되고 검출된다. 분자에서 삽입, 삭제 또는 재배열을 하기 위하여 개별 DNA 분자들의 특징을 밝히고, 궁극적으로는 유전자 질병을 검출할 수 있다.