일반기술

RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법

H 타입을 포함하는 모든 타입의 RNA 슈도노트 구조를 선분 교차없이 평면적으로 명료하게 시각화하여, 구조 파악을 용이하게 하는 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법에 관한 기술로, 본 발명은 서열의 구조가 괄호로 표시되는 구조데이타로부터 각 구조요소 괄호쌍으로 묶여지는 단일 스템-루프, 다른단일 스템-루프를 포함하는 복합 스템-루프, 다수의 스템부와 스템사이에 구비되는 루프의 염기열 또는 스템-루프를 포함하는 내부구조요소로 구분되는 고 슈도노트를 식별하고, 다른 구조요소를 포함하지 않는 최소 구조요소, 즉, 단일 스템-루프로부터 시각화를 수행한후, 해당 단일 스템-루프및 구조요소를 슈도노트에 소정 규칙에 따라서 삽입시킴으로서, 선분 교차없이 명확하게 RNA 슈도노트를 시각화하는 방법임.내부사이클과 슈도노트와 다른 구조 요소사이에 형성된 외부 사이클을 포함하는 RNA 슈도노트 구조를 수작업 없이 자동으로 신속하게 시각화할수 있으며, 더하여, 선분교차없이 2차 평면그래프로 RNA 슈도노트 구조를 시각화함으로서, 관찰자가 해당구조를 쉽게 이해할수 있게 하며, 웹 베이스 프로그램의 알고리즘으로 구현가능함으로서, 이용이 쉽다는 우수한 효과가 있다.본 발명은 타입에 관계없이 모든 종류의 슈도노트 구조를 선분교차 없이 2차 평면그래프로서 자동시각화 할수 있느 우수한 효과가 있다.