일반기술

150여 유산균을 단 한번의 실험으로 정확한 양을 검출하기 위한 게놈 마이크로어레이

본 발명은 유산균 게놈 마이크로어레이 기술을 이용한 유산균 검출용 마이크로어레이를 제공한다. 구체적으로, 본 발명은 시료에서 직접 게놈 DNA를 추출한 후 유산균 게놈 DNA를 프로브로 가지는 유산균 검출용 게놈 마이크로어레이와 하이브리드화하여 시료에 존재하는 유산균의 존재 또는 균주명을 확인할 수 있는 유산균 진단용 게놈 마이크로어레이를 제공한다. 또한, 본 발명은 유산균 게놈 마이크로어레이를 사용하여 유산균 진단하는 방법을 제공한다. 본 발명의 유산균 게놈 마이크로어레이를 사용하여 유산을 생산하는 카르노박테리움(Carnobacterium), 락토바실러스(Lactobacillus), 락토코카스(Lactococcus), 스트렙토코카스(Streptoccccus), 엔테로코카스(Enterococcus), 오에노코카스(Oenococcus), 류코노스톡(Leuconostoc), 페디오코카스(Pediococcus), 비피도박테리움(Bifidobacterium), 바이셀라(Weissella)를 비롯하여 프로피오산(propionic acid)이나 시트르산(citric acid) 발효를 수행하는 프로피오니박테리움(Propionibacterium) 등 인간 및 동물의 소화기, 음식, 환경 등 다양한 시료에서 존재하는 유산균을 신속하게 진단 및 확인할 수 있다.본 발명의 유산균 진단을 위한 게놈 마이크로어레이법은 유산균 전체 게놈을 사용함으로써 기존의 마이크로어레이에 비하여 환경에 극미량 존재하는 미생물을 감지할 때 생기는 낮은 감도를 해결할 수 있고, 정확도가 탁월하게 우수하며, 종 이하 수준이하도 구분하여 분석할 수 있을 정도로 해상도가 높고 검출시간도 매우 단축된다. 또한 올리고머 마이크로어레이 제작시 필수적인 프로브 제작에 드는 비용, 시간, 및 인력이 필요치 않아 경제적이며, 높은 감도와 특이성으로 환경시료에서 DNA 증폭없이 즉시 유산균을 검출할 수 있다. 본 발명의 유산균 검출 및/또는 동정용 마이크로어레이 및 이를 이용한 유산균의 검출 및/또는 동정방법에 의하면, 임상학적으로 중요한 사람과 동물의 소화기 또는 산업적으로 큰 의미가 있는 요쿠르트나 김치와 같은 음식에서의 유산균의 분포 연구를 아주 극소량의 시료로부터 경제적이며 대규모로 신속, 정확하게 분석할 수 있을 것이다.