일반기술

DNA 이차구조의 시각화 방법

본 발명은 DNA 이차구조의 시각화 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 입력 구조 데이터로부터 스템-루프(stem-loop)를 식별하고, 이를 단일 스템-루프 및 복합 스템-루프로 구분하여 좌표 및 모양을 계산하는 단계를 포함하는 DNA의 이차구조를 시각화하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 DNA 이차구조 시각화 방법은 여러 가닥으로 이루어진 DNA의 이차구조를 명료하게 시각화하여, 구조 파악을 용이하게 함으로써 DNA 칩 또는 PCR 등 핵산을 이용한 대량분석 기술분야에 있어서, 프라이머(primer) 또는 프로브(probe)를 고안하는데 유용한 도구가 될 것이다.본 발명은 (ⅰ) 컴퓨터의 입력장치로부터 분석대상 유전자의 핵산의 구조 데이터 및 프라이머 또는 프로브의 구조 데이터를 입력하는 제 1단계; (ⅱ) 입력된 구조 데이터로부터 스템-루프를 식별하는 제 2단계; (ⅲ) 단일 스템-루프의 좌표 및 모양을 계산하는 제 3단계; (ⅳ) 복합 스템-루프의 좌표 및 모양을 계산하는 제 4단계; 및 (ⅴ) 컴퓨터의 출력장치로 상기 계산에 의한 DNA 이차구조를 클라이언트 화면에 출력하는 그래픽 유저 인터페이스(graphic user interface, GUI)를 제공하는 제 5단계를 포함하는 DNA 이차구조의 시각화 방법을 제공하는 것을 특징으로 한다.