일반기술

미도콘드리아 DNA COIII-ND3-ND4L 지역 단염기다형성을 이용한 연어의 유전자형 판별 및 소속 계군 구별법

해당 기술은 연어(salmon) 미토콘드리아 DNA중 COIII-ND3-ND4L 유전자에 단염기다형성이 존재함을 밝히고 이를 각 개체의 유전자형 판별과 소속 계군을 구별하는데 이용하는 방법을 제시한다. 단염기다형성을 포함하는 폴리뉴클레오티드 또는 핵산 단편은 중합효소연쇄반응을 위한 프라이머나 마이크로어레이 방법을 위한 프로브로서 사용되어, 각각의 유전자형을 구분하는데 이용된다. 구체적으로는 다형성 부위를 포함하고, 서열번호 1의 염기서열로부터 유래하는 10개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 또는 상기 뉴클레오티드의 상보체를 포함한다. 해당 기술은 핵산단편 제작에 있어 3‘말단이 각 단염기다형성과 일치하고 그 직전 염기가 모든 유전자형과 불일치하는 제작법을 포함한다. 해당 기술은 연어의 유전자형과 소속 계군을 판별하는 새로운 유전자 표지를 제시하였다는 것과, 위 목적을 실현할 수 있는 새로운 핵산단편 제작 방법을 포함하는 것을 특징으로 한다. 연어 미토콘드리아 DNA중 COIII-ND3-ND4L 유전자는 48개 이상의 위치에서 단염기다형성을 갖고 있으며, 각 연어 개체의 유전자형과 소속 계군이 이 단염기다형성을 포함하는 핵산단편을 이용한 중합효소연쇄반응이나 마이크로어레이 방법으로 구분된다. 핵산단편 제작 방법은 3‘말단을 각 유전자형과 일치시키며, 3’말단에서 두 번째 염기를 모든 유전자형과 불일치하는 방법을 특징으로 한다.