일반기술

헬리코박터 파일로리균의 프로테옴 지도 연구

Helicobacter pylori는 전세계적으로 널리 퍼진 질병 중 하나이다. 그람 음성균(gram-negative bacteria)인 Н. pylori는 인간 위장 점막에서 발견되는데, 만성위염, 위궤양, 십이지장궤양 등의 원인이 되고, 이것이 발전되면 악성종양으로 발전되기도 한다. Н. pylori의 게놈은 현재까지 연구된 박테리아들 중 가장 변화가 심한 것으로 알려져 있다.Н. pylori의 균주는 십이지장궤양과 만성위염 환자들의 바이옵시(Biopsy)에서 추출한 것이다 (이 환자들은 모스크바와 모스크바주, 그리고 노보시비르스크 두 지역에서 선발됨). 트립신 가수분해물의 이합체 젤 전기영동과 MALDI-TOF-MS로 박테리아 프로테옴 지도를 만들었다. 이 지도에 나타난 약 500개 단백질이 이미 분석되었으며, 105개는 그 정체가 확인되었다. 프로테옴 지도에서 Н. pylori 균과 가장 많이 닮은 단백질의 위치를 평가하였으며, 그 중 몇 개는 발현정도도 평가하였다.병균연구는 프로테옴 지도에서 동일한 타입의 변화를 겪는 것들을 묶어서 진행하였는데, 총 두 그룹이 만들어졌고, 그 중 한 그룹에는 서로 다른 지방들에서 얻은 병균들이 포함되었다.(모스크바주와 노보시비르스크)프로테옴 지도에서 등전점(Isoelectric dots) 차이에 따라 다음과 같은 특징들이 확인되었다.세포단백질 샤페론(chaperone) groEL (60 kDa)트리거 팩터 trigger factor (tig)질병부위 단백질 Cag26;아데노신 삼인산(ATP)에 속해있고, 프로테이나아제와 결합하는 sub-unit헤몰리신(hemolysin)을 분비하는 전구단백질 (precursor protein)전사(transcription) 조절인자로 추정되는 물질초과산화물 불균등화 효소(superoxide dismutase)와 NADPH-flavinoxyreductase의 자유래디컬과 과산화수소(Hydrogen peroxide)를 불활성화시키는 효소들 세포벽 리포 프로테인 성분비혈청 페리틴(ferritin)발현정도에 따른 일련의 단백질들의 변화가능성이 규명되었다. 예를 들어 질병요인이 되는 단백질점 cag26(독성부위 유전자)의 경우 일부 임상분리균(clinical isolate) 지도들에서 발견되지 않았다. 지도에서 일정한 단백질점들이 부재하는 것은 단백질 발현이 억제되어서 그렇거나 또는 게놈에서 해당 유전자가 누락되었기 때문이다.