일반기술

카나마이신 A에 특이적으로 결합하는 RNA서열

항생제, 특히 아미노글리코시드 항생제에 특이적으로 결합하는 RNA서열에 관한 것이다. 기존에 SELEX 방법으로 여러 가지 아미노글리코시드에 대해 강력히 접합하는 RNA를 찾았으나, 불행하게도 그 염기서열이 서로 일치하지 않는 결과를 보여 주었다. 본 기술은 SELEX 법을 사용하여 특정물질에 특이적으로 결합하는 RNA를 선택함에 있어서, 무작위의 70 뉴클레오타이드에 5 또는 3에 프라이머 열을 연결하여 약 131 염기의 RNA을 사용하여 고상에 고정환 항생제를 특이적으로 결합하는 RNA서열을 선택하는 것으로 이루어지는, 항생제에 특이성이 높은 RNA서열을 선택하는 방법을 제공하는 것이다. SELEX 법을 사용하여 특정물질에 특이적으로 결합하는 RNA를 선택함에 있어서, 무작위의 70염기에 5또는 3에 프라이머 서열을 연결하여 100염기 내지 200염기의 뉴클레오타이드의 RNA을 사용하여 고상에 고정한 항생제에 특이적으로 결합하는 RNA서열을 선택하는 것으로 3차원적 다양성을 높이고 좀 더 식별력이 있는 상태에서 선택과정을 진행하여 아미노글리코시드의 하나인 카나마이신 A에 잘 접합하는 RNA 염기서열을 확인하고자 한다. 선택된 RNA를 방사선 동위원소를 이용하여 목표분자인 카나마이신 A와의 특이성과 친화력을 BIACorTM라는 바이오센서를 이용하여 목표분자와의 친화력을 측정한다. 본 기술은 카나마이신 A에 특이적으로 결합하는 RNA서열 및 이러한 RNA서열의 특이성이 높은 선택방법을 제공하여, 역방향 신약개발방법(reverse drug discovery)에 용이하게 이용할 수 있어 신약 개발에 대한 비용절감 및 카나마이신의 새로운 표적 분자를 용이하게 찾을 수 있다.