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나노미터 규모 전위계("NSE")를 이용해 직접적으로 RNA 중합 효소를 관측하며 DNA의 염기 서열을 결정하는 방식이다, 이 NSE는 집적 회로 칩상에서 생성된다, 이론상 단일 칩은 평행하게 작동되는 백만 NSE를 가지고 있고 초당 100개의 뉴클레오티드 속도로, 즉 일분 이내에 30억 전체 사람 염기쌍의 순서를 결정할 수 있다평행 작업은 매우 빠른 염기 서열을 생성한다
C형 간염 바이러스에 대한 부분적 방어를 제공하는 사람 면역 반응이 알려지고 있다, HCV E2 단백질의 과변화 부위내 분리주 특이적 항원 결정기에 대한 항체는 여러 계에서 HCV 감염력을 무력화시킨다, 그러나 가장 잠재적인 치료 이점은 분화형 HIV 분리주를 무력화시킬 수 있는 항체에서 유래된다, HCV E1과 E2에 대해 광범위한 반응성을 지니며 배좌 의존적 항원 결정기를 인식할 수 있MS 항체가 가정되었다, HCV E3 단백질에 대한 일곱 개의 사람 단일 클론 항체(HMAb)가 생성되었고 이 항체들은 모든 HCV 유전형과 반응하였다, 이 작업의 결과는 잠재적인 바이러스 무력화 활성을 가진 보존적 배좌 항원 결정기에 대한 사람 항체가 몇 HCV 감염된 개인에게서 분리될 수 있다는 것이다 잠재적인 바이러스 무력화 활성을 가진 보존적 배좌 항원 결정기에 대한 사람 항체가 몇 HCV 감염된 개인에게서 분리될 수 있다
CD81 결핍 마우스가 생성되었다, 명시된 첫 CD81-/- 마우스이다, 이 마우스는 정상적인 T 세포 성숙과 정상적인 B 세포 발생을 가지나 CD19는 더 낮게 발현한다CD81 결핍 유기체에서 표현형 결과 연구, C형 간염 바이러스 감염력 연구에서 동물 모델로 CD81-/- 마우스 이용, 사람 CD81은 HCV에 대한 세포 수용체로 알려져 있다, 이 바이러스가 자랄 수 있는 유일한 유기체는 사람과 침팬지이다, 사람 CD81을 인코딩하는 유전자가 "knocked in"으로 유입된 CD81-/- 마우스는 소형 동물에서 HCV 감염 연구를 위한 모델이 된다
Mr. Myers등이 예전에 발견한 염색체 21상의 사람 시스타틴 B 유전자의 특이적 기능 손실 돌연 변이는 사람 유전병인 진행성 미오클론 간질(EPM1)을 일으킨다, 사람 간질의 첫 동물 모델인 EPM1 마우스 모델이 생성되었다, EPM1에 대한 마우스 모델은 EPM1과 기타 진행성 미오클론 간질에 대한 치료 개발에 효과적이다, 추가적으로 이 마우스는 dilantin과 시스테인 프로테아제 그리고 저해제의 작용 기작과 아폽토시스 그리고 각막 결함에서의 시스타틴 B 역할 규명에도 유용한 모델로 쓰인다사람 간질에 대한 첫 마우스 모델로 추후 간질 마우스 모델 개발과 간질 치료 표적 개발에 기여한다
In vivo상에서 표준 기술로는 세포 독성의 불안정한 불용성 단백질을 생성하기는 어렵다, 세포 유리 단백질 합성은 이런 문제를 극복할 수 있고 특이한 아미노산 유입에도 유용하다, 그러나 예전 in vitro 방법은 짧은 반응 시간과 비싼 시약으로 인해 비효율적이었다, 세포 유리 단백질 합성 계를 최적화하는 새로운 기술과 물질이 고안되었다, 이 계의 인자는 저비용의 항상성 에너지원과 증진된 아미노산 대사를 위한 조건을 포함한다, CAT 합성 분석에서 이 계는 상업적으로 이용되는 기존 장비보다 증가된 단백질 수율을 보여 준다세포 독성의 불안정한 불용성 단백질을 생성, 특이한 아미노산 삽입 가능, 기존 in vitro 방법보다 더 높은 수율의 저비용
아데노 바이러스 계는 유전자 전달 연구를 위한 재조합 E1 혹은 E1/E3 결실 아데노 바이러스 생성을 위한 간단하고 효율적인 방법이다, 이 방법에 의한 재조합 아데노 바이러스 생성은 보통의 분자 생물학 클로닝 기술로 실행되며 아데노 바이러스 생성을 방해할 수 있는 진핵 생물 세포 그리고/혹은 원핵 생물 세포내 재조합 단계는 포함되지 않는다, 기존 과정보다 시간을 단축시키도록 변형되었다, 바이러스 벡터로 클론될 발현 카세트 염기 서열은 젤상에서 정제하지 않는다, E1/E3/E4 결실 벡터를 생성하는 유사한 전략이 진행중이다, 따라서 예전에 아데노 바이러스를 다루어 보지 않은 모든 분자 생물학 랩에서 벡터를 만들 수 있다재조합 단계가 필요 없어 빠르고 효율적인 방법, 293 세포에서의 재조합 단계는 비효율적이며 시간이 많이 소모되고 아데노 바이러스 생성을 위해선 전문가가 필요하다, 세균내 재조합은 특별한 세균 계통과 부가적인 과정들이 필요하다, 이론상 세포 독성 단백질을 발현하는 몇 벡터가 계에서 생성될수 있다
매해 어린이들을 비롯해 많은 환자들이 열병에 걸린다, 열병의 가장 흔한 원인은 서구에서 박멸되었던 세 가지 폴리오 바이러스 혈청형을 포함하는 장바이러스이다, 불행히 65개의 기타 장바이러스도 여전히 활발한 전염성을 지니며 이를 동정하는데에는 많은 시간과 비용이 들고 채혈이 필요하다, 바이러스 감염이 진단되지 못하면 많은 열병 환자는 비싼 항생제에 의한 세균 감염 치료를 받아야 한다, 그래서 6시간내에 결과를 알 수 있으며 병실에서 행해지는 장바이러스 검정 기술이 고안되었다, 예전의 검정은 느리고 채혈을 필요로 하며 흔히 부정확한 결과를 도출한다, 한편 이 기술은 매우 민감하며 특이적으로 오직 채변만으로 쉽게 검정할 수 있다비채혈성, 매우 민감하며 특이적, 병원 비용도 줄인다는 점에서 비용 효율적, 환자와 보호자, 어린이의 두려움을 감소시킴
조혈 간(stem) 세포의 임상 적용시 문제점은 T 세포를 효율적으로 인식하자 못한 다는 것이다, Committed T 세포 전구체(CTP)는 오직 T 세포 면역계를 빠르게 재구성하는 골수에서 유래된 새로운 세포 타입이다, 마우스 골수의 in vitro 연구에 의하면 흉선 기관 세포나 외부 시토킨의 부재하에서 48시간 내에 CD4+와 CD8+ T 세포를 생성한다, In vivo에서 CTP는 B 세포, NK 세포 혹은 미엘로이드/단구 세포가 아닌 T 세포를 재구성한다, 골수와 비장은 흉선전에 재구성된다흉선과 골수에서 T 세포의 재구성, 알로겐 가능성, 성숙한 T 세포의 피드백 저해를 가짐
T 세포 면역성 결여에 관련된 새로운 유전자 연구로 처음에 스탠포드 의대의 Fathman과 Bloom 박사가 T 세포 면역성 결여에 관련된 몇 개의 유전자에 대한 부분적 정보를 발견하였다, 현재 다섯 개의 면역성 결여 유전자를 동정하였는 데, 그 중 세 개는 새로운 것으로 면역 억제 촉진에 이용될 수 있다, 원래 연구 : T 세포 면역성 결여 상태에서 독특하게 발현되거나 촉진 조절되는 몇 개의 새로운 유전자를 차동 디스플레이 법으로 동정하였다, 이 유전자의 몇 개는 뮤린에서 동정되었으나 궁극적으론 사람 유전자가 동정되어야한다, 여러 경우에서 새로이 동정된 면역성 결여 유전자는 데이터베이스에서 상동체를 가지지 못하였다, 이 유전자는 휴지기의 뮤린 T 세포 클론, 활성기의 클론 그리고 면역성 결여 클론에 해당하는 cDNA 이용 상업적 차동 디스플레이 장비를 통해 세 각기 레인에서 mRNA를 달리게 하는 차동 디스플레이 기술로 동정되었다, 활성화된 세포는 MHC 결합내 항원과 B7 발현을 위해 트랜스펙션된 L 세포의 사용을 통해 활성화 신호를 모두 받는다, 면역성 결여 T 세포는 동시 촉진 부재하에서 B7 발현에 트랜스펙션되지 않았던 L 세포를 이용해 작당한 MHC내 항원을 표식한다, 새로운 연구: 두 가지 "in vivo 면역성 결여 유도"계를 이용해 면역성 결여 표현형이 개발되었다, 이 면역성 결여 클론된 T 세포내 mRNA 발현은 휴지기나 활성화된 조건하의 T 세포내 mRNA 발현과 비교된다, 면역성 결여 세포와 활성 세포간의 비교를 통해 다섯 개의 후보 "면역성 결여 유전자"가 동정되었다, 네 개는 알려진 유전자와 부분적인 혹은 상당한 유사성을 가지며 나머지 한 개는 알려진 어느 유전자와도 상동성을 갖지 않는다, 이 유전자중 세 개는 새로운 것으로 면역 조절의 새로운 표적이 될 수 있다, 이 유전자의 정보는 매우 유용하며 T 세포 활성화 조절 역할이 가능하다네 개는 알려진 유전자와 부분적인 혹은 상당한 유사성을 가지며 나머지 한 개는 알려진 어느 유전자와도 상동성을 갖지 않는다, 이 유전자중 세 개는 새로운 것으로 면역 조절의 새로운 표적이 될 수 있다, 이 유전자의 정보는 매우 유용하며 T 세포 활성화 조절 역할이 가능하다
Naked Cuticle(nkd)는 Wnt 신호 Wingless(Wg)의 유도성 길항 물질을 인코딩하는 새로운 유전자이다, 처음 보고되는 Wnt 신호 유도적 길항 물질이다, Wnt 단백질에 의한 신호 전달은 배발생과 심장, 근육, 신경, 피부의 재생성을 포함하는 발생 생물학의 여러 분야에 관련되어 있다, Wnt 유전적 경로는 또한 사람 유방암, 결장암등의 병에도 관여한다, nkd가 인코딩하는 단백질은 미리스토일 스위치 단백질의 recoverin 계통과 유사한 단일 EF 핸드를 가진다, 사람과 마우스 유사체도 동정되었다척추 동물 세포에서 Wnt 신호 전달의 강력한 길항 물질, 유도성-유전자 활성 상태는 Wnt 신호 전달에 비례해 남아 있다, 관련 조절 인자는 다른 유전자가 Wnt 조절의 동일한 타입을 받게 한다, nkd 발현은 Wnt 신호의 수용을 알려 준다, 이온 흐름 조작으로 활성이 조절될 수 있다
열적으로 그리고/혹은 광화학적으로 교차 결합된 올리고머 전구체로부터 시약이나 강도 높은 가공 과정 필요 없이 불용성 전기 활성 중합체를 제조하는 방법이다, 따라서 유독 물질의 유입이나 의도하지 않은 부산물의 생성 없이 중합체 엷은 막이 제조된다열적으로 그리고/혹은 광화학적으로 교차 결합된 올리고머 전구체로부터 시약이나 강도 높은 가공 과정 필요 없이 불용성 전기 활성 중합체를 제조하는 방법
다중 경화증(MS)에서 중추 신경계에 대한 염증성 손상은 항체와 T 세포 중재적 미엘린 수초 파괴로 나타난다, HLA DR2(MS 환자의 3분의 2가 해당)인 MS 환자에서 미엘린 염기성 단백질의 특이적 부위에 대한 주요 공격은 T 세포나 B 세포에 의해 수행된다, MS 치료 목적으로 T 세포 활성화를 방해하는 펩티드가 디자인되었다, 이 펩티드는 부류 II 주요 조직 적합성 복합체(MHC) 분자내 결정적인 결합 포켓에 결합한다, 이런 양상으로 MS를 가진 동물 모델의 자가 면역 뇌척수염을 효과적으로 치료하였다MS를 가진 동물 모델의 자가 면역 뇌척수염을 효과적으로 치료
세포 표면 표식체를 이용해 순수한 세 가지 마우스 조혈성 전구체를 분리하였다, 마우스 골수의 0.2%에 해당하는 흔한 미엘로이드 전구체는 모든 조혈성 콜로니 형성 단위(CFU)를 생성한다, 거대 핵세포/적혈구 전구체(MEP)는 CFU-거대 핵세포/적혈구, CFU-거대 핵세포, 격발-형성 단위 적혈구 그리고 CFU-적혈구를 생성하고 단구 세포/과립구 전구체(CP)는 CFU-과립구/대식 세포, CFU-과립구 그리고 CFU-대식 세포를 생성한다, In vivo 이식된 CMP는 MEP, GMP 그리고 모든 미엘로적혈구성 전구체를 포함해 위 모든 전구체를 생성한다, 이 세포들에 대한 사람 동량체는 유사성 세포 표면 표식체로 예측되며 분리가 진행중이다, 각 세포를 간(stem) 세포로 첨가시켰을 때 치명적으로 조사된 기주에서 혈소판, 적혈구 세포, 백혈구 세포의 더 빠른 주입이 유발되는가를 시함중이다, 이 세포들은 균일하게 분리되어 발현 유전자, 수용체, 신호 전달 경로, 특이적 전사 인자 그리고/혹은 후보 인자와 단백질에 대한 반응을 조사하는데 쓰인다, 예를 들면 면역 혈소판 감소 자반병, 화학 치료후, 골수 이식후 조건에서 선택적으로 혈소판을 재생성하는 특이적이고 안전한 방법이 이제까지는 없었다, CMP 그리고 MEP로의 접근은 이식시 세포의 문제 해결뿐만 아니라 유전자 발견, 수용체 선별 그리고 리간드 선별등을 가능하게 해준다, 세포의 분리뿐만 아니라 정량화를 위한 고도로 정제된 세포 그리고 혹은 항체가 없이는 세포, 인자, EST같은 세포 근거 응용에 효과적으로 사용될 수 없다CMP 그리고 MEP로의 접근은 이식시 세포의 문제 해결뿐만 아니라 유전자 발견, 수용체 선별 그리고 리간드 선별등을 가능하게 해준다
스탠포드 의대 생화학부의 Guri Giaever와 Ron Davis 박사는 화합물 바이오 활성을 측정하는 새로운 계를 개발하였다, 이 계는 1)약제 처리에 반응하는 세포의 민감성과 저항성 특정에 매우 민감한 방법이며 2) 변경된 유전자 양을 갖는 세포에서 약제 표적 동정를 할 수 있게 하며 3)효모내 어떤 표적에도 길항 작용할 수 있는 화합물에 대한 세포 근거 분석이 가능하다, 화합물에 대한 세포 반응에 관여된 유전자에 리포터를 첨가함으로써 진핵 생물 세포의 효과적 약제 처리 식별을 위한 생물학적 계가 생성되었다, 변형된 세포가 처리에 반응할 때 화합물이 세포에 활성을 가짐을 알려 주며 리포터가 발현된다, 변형된 세포가 처리에 반응하지 않을 때에는 1)약제가 세포에 대해 활성을 갖지 못하거나 2)세포가 화합물에 저항성임을 뜻한다, 세포 반응을 측정하는 것은 또한 Tagman 혹은 유사 분석을 이용해 할 수도 있다10분에서 20분내로 빠르게 판독할 수 있다 : 현재 방법으로 약제가 세포에 활성을 갖는가를 알려면 수시간 내지 며칠이 걸린다, 이 계를 이용해 세포와 약제와의 상호 작용을 10분에서 20분내로 결정할 수 있고 세포 생장을 필요로 하지 않는다, 많은 작업 처리량의 자동화에도 적합, 현재 쓰이는 방법보다 더 민감하다
연골과 연성 조직에서 미네랄 분해를 조절하는 새로운 세포 표면 단백질을 인코딩하는 유전자가 동정되었다, 유전자의 증가된 활성은 미네랄 분해의 천연 저해제임을 설명해 주고관절 연골을 석회화로부터 보호한다, 유전자의 감소된 활성은 천연 미네랄화 저해제의 감소를 초래해 심각한 관절염, 관절병 그리고 몇 연성 조직에서의 증가된 미네랄 분해를 초래한다새로운 유전자와 새로이 발견된 작용 기작, 세포 표면에서 정상적으로 발현되는 유전자 산물, In vitro 조직 배양 계에서 쉽게 측정되는 생물학적 활성, 노화 인구의 3분의 1에 해당하는 병리 기작에 명백한 영향을 주는 유전자 활성
삽입 염기 서열 같은 배경 반복 인자는 임상과 역학 연구에서 분화된 세균 계통의 유전적 표식체로 이용된다, 더욱이 도입된 혹은 자연적으로 세균 게놈에서 발견되는 반복 인자, 삽입 염기 서열 혹은 전치 인자의 위치는 유전자 기능에 대한 중요한 정보를 제공한다, 염기 서열 존재, 복제 수, 특히 삽입 인자의 삽입 부위를 측정하는 빠르고 신뢰할 만한 방법이다, 삽입 부위는 핵산 증폭과 hybridization을 통해 동정된다, 한 표본내에서 모든 삽입 부위를 동시에 동정할 수 있는 과정으로 Sitetypingd이라 명명한다, 전체 Mycobacterium tuberculosis(M. tb) 염색체 전체에 IS6110 삽입 인자를 도입한 방법이다세균, 진균, 식물 그리고 곤충 게놈뿐만 아니라 사람 게놈을 포함한 모든 염기 서열 형태의 게놈에서 반복성 인자나 삽입 염기 서열 같은 보존적 염기 서열의 게놈내 위치 결정에 폭넓게 이용된다, M.tb에 대한 고해상도 유전자 타이핑 기술은 M.tb와 기타 유기체의 병독성 그리고 약제 저항성 같은 기능적으로 중요한 특성을 알려 준다
Rin2가 Ras 중재성 신호 전달의 새로운 조절체임이 밝혀졌다, 이 발견은 암에서 세포 증식의 억제 조절 수단을 제공하고 천식과 알레르기 반응의 개선된 조절을 가져 올 수 있다, Rin2는 다양한 리간드/수용체 상호 작용에 의해 개시되는 Ras 중재성 신호 전달 과정과 관련 세포의 기능적 반응에 대한 새로운 억제성 조절체이다, Rin2 발현은 세포 활성화 초기 단계에선 감소하고 세포 활성화 종결 단계에서 정상 수준으로 되돌아간다, 그런 활성화된 세포에서의 Rin2 단백질 수준의 지속적 고갈은 신호 전달과 기능적 반응의 리간드 의존적 그리고 Ras 중재성 활성화의 증진을 초래한다낮은 부작용-세포가 활성화된 후에 Rin2는 활성을 나타낸다 : Rin2 발현 변경은 기저 상태의 세포에 최소한의 효과만 준다
브리오스타틴은 여러 사람 암에 대해 강력한 저해 활성을 갖는 천연 존재 화합물이다, 골수 전구체 세포의 정상적 생장을 촉진하고 치명적인 이온화 방사선 조사에서 세포를 보호하고 면역 계 반응을 촉진하며 다중 약제 저항성을 역전시킨다, 브리오스타틴은 기존 항암제와는 다른 작용 양상이거나 보완적인 방법으로 작용한다, 브리오스타틴은 원래 해양 bryozoa에서 분리되나 낮은 천연적 존재와 빈약한 합성 수율로 인해 생성이 제한적이었다, 스탠포드 화학자들은 단순화된 구조로 어떻게 브리오스타틴이 작용하는 가를 알아내어 만들기 쉬운 유사체를 합성해 많은 사람 암 세포 계통에서 더 나은 결과를 얻었다더 쉬운 합성, 개선된 효력
마이크로이미지에서 유래한 공극 공간의 통계적 성질로부터 바위의 공극성, 투과성, 전기 형성 인자 그리고 탄성-파 속도를 계산하는 방법이다, 암석의 물리적 성질을 돌결(grain) 분류, 시멘트 위치, 돌결 양상을 포함하는 암석의 구성과 연계시킬 수 있게 해준다, 결과적으로 물리적 성질은 diagenetic 경로와 분해 환경과 관련된다, 끝으로 투과성이 공극성, 저항성 그리고 음파같은 기본적이고 향상된 로그 데이터로부터 예측될 수 있다는 점에서 물리적 성질들은 서로 연관되어 있다전통적인 바위 분석보다 실행하는 게 단순하다
방사선 치료에서 사용되는 강도 조정형 광선의 모니터 단위("MU") 계산의 간단하고 효율적인 방법이다, 광선의 사용량/MU 그리고 투과량/MU를 이용해 처리될 계획 계의 MU 계산이 쉽고 효율적으로 얻어진다Leaf 서열 알고리듬과 전달 기계에 독립적인 기술이다, 임상 적용을 위한 빠른 사용량 공식화